「個別指導のメリット」が、ただ単に2：1などの「少人数だから」とお考えであれば、必然的にデメリットは「先生との相性次第」ということにはなるかと思います。

しかし、個別指導として、スポーツなどでいうところの「プライベートコーチ」という指導イメージして考え、「あなたのタイプの場合は…」というような指導がなされる”べき”であるとするのであれば、「先生との相性」というのが、個人のパーソナリティ次第という意味ではなく、その塾として「どのような指導をすること」が提供価値であるかという方針や、講師教育の在り方の問題だということになります。

「勉強する」ということが、「問題演習して間違ったところを教わる」ということだと考えているなら、「集合授業の少人数版」でしかありませんが、本来の「個別指導」とは、ひとりひとりの個性・特性に合わせて「ものの見方・考え方を変える」というような、いわゆる反転学習・探求的学習活動にも通じる”学び”として、「対話学習をする」ための個別指導だと考えると、メリット・デメリットの概念も変わってくるかと思います。
なお、そのような対話学習として考えた場合の個別指導のデメリットとは、意見バリエーションを広げにくい。ということになるのではないでしょうか。

追伸：拙書「なぜ個別指導で成績が上がらないのか？」という小冊子をAmazonｵﾝﾃﾞﾏﾝﾄﾞで出版しておりますので、よろしければそちらも参考にしていただけると幸いです。

個別指導塾にもいろいろありますし、成績が上がらないというのも通塾期間や通塾前の成績によって考え方が異なります。
しかし、最も大きな問題点は「自分では宿題をやらない」と言うところだと思われます。
私の塾では、宿題をやらない生徒は塾に来る回数を増やすように提案しています。つまり、塾で宿題をやってもらうのです。塾に来ているのに勉強をしない生徒はほとんどいません。単なる自習ではなく、答え合わせや解説は教師が行っているので無料と言うわけではありません。でも通い放題コースであっても、それほど高くないリーズナブルな学費に設定しているつもりです。このようなシステムを持っている塾を探してみてはいかがでしょうか。

友達がいるから塾に通うことが楽しいのであればトータルプラスかと。

休憩時間におしゃべりすることを問題視していますが、ごく当たり前の光景のように思えます。

また、帰宅後に友達の話を嬉しそうにしてくれるなんて、とってもいいことではないでしょうか？

お嬢さんの成績低下の原因と、塾の友達が関係しているという仮説を十分検証する必要があります。

もしかしたら、原因は違うところにあるのかもしれません。

また、この時分のティーンエイジャーは、友達付き合いに口を挟んでくる大人を毛嫌いする傾向にあります。たとえそれが両親であったとしても。

なので、「このまま成績が下がっていくなら、塾を続けさせてあげれない」と伝えてみるのはどうでしょう？

友だちがいるからこそ、勉強をやる理由となるように工夫してみましょう